Fang, S., Xu, M., Cao, L., Liu, X., Bezulj, M., Tan, L., Yuan, Z., Li, Y., Xia, T., Guo, L., Kovacevic, V., Hui, J., Guo, L., Liu, C., Cheng, M., Lin, L., Wen, Z., Josic, B., Milicevic, N., Qiu, P., Lu, Q., Li, Y., Wang, L., Hu, L., Zhang, C., Kang, Q., Chen, F., Deng, Z., Li, J., Li, M., Li, S., Zhao, Y., Fan, G., Zhang, Y., Chen, A., Li, Y., Xu, X. (2025). Stereopy: modeling comparative and spatiotemporal cellular heterogeneity via multi-sample spatial transcriptomics. Nature Communications. https://doi.org/10.1038/s41467-025-58079-9